SARS-CoV-2: Kako resna je različica B.1.1.529, ki se zdaj imenuje Omicron

Različica B.1.1.529 je bila prvič sporočena WHO iz Južne Afrike 24^th novembra 2021. Prva znana potrjena okužba z B.1.1.529 je bila iz vzorca, zbranega 9.^th november 2021¹. Drug vir² kaže, da je bila ta varianta prvič odkrita v vzorcih, zbranih 11^th novembra 2021 v Bocvani in 14^th novembra 2021 v Južni Afriki. Od takrat se je število primerov COVID-19 strmo povečalo v skoraj vseh provincah Južne Afrike. Kot 27^th Novembra 2021 so poročali tudi o novih primerih te različice v Belgiji, Hongkongu, Izraelu, Združenem kraljestvu³, Nemčija, Italija in Češka, ki so po poreklu povezane s potovanji.  

Hvala južnoafriškim oblastem, da si niso vzeli časa za komuniciranje in izmenjavo ustreznih informacij s svetovno znanstveno skupnostjo, da bi se strokovna skupina WHO lahko sestala 26.^th novembra 2021 in to različico hitro označite kot varianto, ki povzroča skrb (VOC). Resnost zadeve je bilo mogoče oceniti iz dejstva, da je bila B.1.1.529 označena za varianto pod nadzorom (VUM) šele pred dvema dnevoma, 24.^th novembra 2021, preden je bil 26. imenovan za VOC^th novembra 2021, ne da bi bil najprej označen kot varianta v preiskavi (VOI).  

Tabela: Skrbne različice SARS-CoV-2 (VOC) na dan 26. novembra 2021 

Nujnost pri določitvi B.1.1.529 kot variante, ki povzroča zaskrbljenost (VOC), je bila upravičena, ker je bilo ugotovljeno, da je ta različica najbolj divergentna različica SARS-CoV-2 doslej. V primerjavi z virusom SARS-CoV-2, ki so ga prvotno odkrili v Wuhanu na Kitajskem, ima ta kar 30 sprememb aminokislin, 3 majhne delecije in 1 majhno vstavitev v spike protein. Od teh sprememb se jih 15 nahaja v receptorski vezavni domeni (RBD), delu virusa, ki mu omogoča vstop v človeške celice, kar vodi do okužbe. Ta varianta ima tudi številne spremembe in izbrise v drugih genomskih regijah². Mutacije so tako obsežne, da bi ga lahko imenovali nov sev, namesto različica. Neverjetno velika količina konic mutacij pomeni povečano možnost pobega pred znanimi protitelesi, zaradi česar je ta različica resno zaskrbljujoča.⁵.  

Prehod na nove različice je običajen za koronaviruse. Od nekdaj je bila narava, da so koronavirusi podvrženi mutacijam v svojih genomih z izjemno visokimi stopnjami, zaradi pomanjkanja lektorske nukleazne aktivnosti njihovih polimeraz; več prenosa, več napak pri replikaciji in s tem več mutacij se kopiči v genomu, kar vodi do novih variant. Človeški koronavirusi v nedavni zgodovini ustvarjajo mutacije, da bi ustvarili nove različice. Od leta 1966, ko je bila posneta prva epizoda, je bilo več variant, odgovornih za epidemije⁶. Toda zakaj tako obsežna mutacija v enem samem izbruhu? Morda zato, ker se je različica B.1.1.529 razvila med kronično okužbo osebe z oslabljenim imunskim sistemom, morda nezdravljenega bolnika z virusom HIV/AIDS⁷.  

Ne glede na to, kaj je vzrok za obsežne mutacije, če je hitra hitrost, s katero se je razširila v Južni Afriki, kakršen koli znak, ima lahko razvoj te različice izjemen vpliv na imunost, prenosljivost in virulenco ter učinkovitost obstoječih cepiv, ki se trenutno uporabljajo.  

O tem, ali bodo obstoječa cepiva ostala učinkovita proti tej novi različici, ali pa bo več primerov okužb, ki prebijajo cepivo, je trenutno na voljo malo podatkov, da bi lahko sklepali. Vendar pa je v nedavni študiji sintetična varianta z 20 mutacijami v spike proteinu pokazala skoraj popoln pobeg pred protitelesi.⁷. To kaže, da lahko nova varianta B.1.1.529 z veliko več povečanimi mutacijami kaže znatno zmanjšano nevtralizacijo s protitelesi. Vendar se zdi, da je nova različica bolj prenosljiva zaradi hitre hitrosti, s katero je nadomestila različico Delta v Južni Afriki, čeprav trenutni podatki niso dovolj ustrezni za izdelavo kakršne koli zanesljive ocene. Podobno v tej fazi ni mogoče komentirati resnosti simptomov.  

Glede na to, da se Evropa v zadnjih nekaj tednih že spopada z nenavadno velikim številom primerov COVID-19 (zaradi zelo prenosljive delta variante) in hitro stopnjo, Micron (B.1.1.529) se je v Južni Afriki razširila različica, ki je nedavno nadomestila različico delta, več držav v Evropi, vključno z Združenim kraljestvom, Nemčijo in Italijo, je uvedlo omejitve potovanja za prihode iz Južne Afrike in iz sosednjih držav, kot so Bocvana, Malavi, Mozambik, Zambija in Angola. Izrael naj bi v strahu pred najhujšim prepovedal vstop obiskovalcem iz vseh držav.  

Svet je toliko vložil v razvoj in dajanje cepiv proti COVID-19 za zaščito ljudi pred pandemijo. Vprašanje, ki je najbolj v mislih znanstvenikov in oblasti, je, ali bodo glavna cepiva proti COVID-19, kot so Pfizer–BioNTech, Oxford–AstraZeneca, Moderna, Johnson & Johnson, ostala učinkovita tudi proti različici Omicron (B.1.1.529). . To je posledica dejstva, da so v Južni Afriki poročali o prebojnih okužbah. Tudi oba primera v Hongkongu sta prejela odmerke cepiva⁹. 

Razvoj "pankoronavirusnih" cepiv¹⁰ (platforme za večvalentna cepiva¹¹) zdi se, da je potreba ure. Toda hitreje bo morda mogoče hitro izdelati obnovitvene odmerke cepiv mRNA in DNK, ki pokrivajo mutacije. Poleg tega nedavno odobreno protivirusna zdravila (Merckov Molnupiravir in Pfizerjev Paxlovid) bi morala biti priročna pri zaščiti ljudi pred hospitalizacijo in smrtjo.   

 *** 

Reference:  

1. WHO 2021. Novice – Klasifikacija Omikrona (B.1.1.529): Varianta skrbi za SARS-CoV-2. Objavljeno 26. novembra 2021. Dostopno na spletu na https://www.who.int/news/item/26-11-2021-classification-of-omicron-(b.1.1.529)-sars-cov-2-variant-of-concern  

2. Evropski center za preprečevanje in nadzor bolezni. Posledice nastanka in širjenja SARSCoV-2 B.1.1. 529 varianta zaskrbljenosti (Omicron), za EU/EGP. 26. november 2021. ECDC: Stockholm; 2021. Na voljo na spletu na https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/threat-assessment-brief-emergence-sars-cov-2-variant-b.1.1.529  

3. Vlada Združenega kraljestva 2021. Sporočilo za javnost – identificirani prvi primeri različice Omicron v Združenem kraljestvu. Objavljeno 27. novembra 2021. Na voljo na https://www.gov.uk/government/news/first-uk-cases-of-omicron-variant-identified   

4. SZO, 2021. Sledenje različicam SARS-CoV-2. Na voljo na spletu na https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/ 

5. GitHub, 2021. Thomas Peacock: potomec B.1.1, povezan z južno Afriko z velikim številom mutacij Spike #343. Na voljo na spletu na https://github.com/cov-lineages/pango-designation/issues/343 

6. Prasad U.2021. Različice koronavirusa: kaj vemo do zdaj. Znanstveni evropski. Objavljeno 12. julija 2021. Na voljo na spletu na http://scientificeuropean.co.uk/covid-19/variants-of-coronavirus-what-we-know-so-far/ 

7. GAVI 2021. Delo cepiva – Kaj vemo o novi različici koronavirusa B.1.1.529 in ali nas mora skrbeti? Na voljo na https://www.gavi.org/vaccineswork/what-we-know-about-new-b11529-coronavirus-variant-so-far 

8. Schmidt, F., Weisblum, Y., Rutkowska, M. et al. Visoka genetska ovira za pobeg poliklonskih nevtralizirajočih protiteles SARS-CoV-2. Narava (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-04005-0 

9. Močno mutirana različica koronavirusa spravlja znanstvenike v pripravljenost. Narava Novce. Posodobljeno 27. novembra 2021. DOI: https://doi.org/10.1038/d41586-021-03552-w  

10. Soni R. 2021. "Pan-coronavirus" cepiva: RNA polimeraza se pojavi kot tarča cepiva. Znanstveni evropski. Objavljeno 16. novembra 2021. Dostopno na http://scientificeuropean.co.uk/covid-19/pan-coronavirus-vaccines-rna-polymerase-emerges-as-a-vaccine-target/  

11. NIH 2021. Sporočilo za javnost – NIAID izdaja nove nagrade za financiranje cepiv za "pan-coronavirus". Objavljeno 28. septembra 2021. Dostopno na https://www.nih.gov/news-events/news-releases/niaid-issues-new-awards-fund-pan-coronavirus-vaccines  

***