Koronavirusi so RNA virusi ki pripada družini coronaviridae. te virusi kažejo izjemno visoke stopnje napak med replikacijo zaradi pomanjkanja lektorske nukleazne aktivnosti njihovih polimeraz. Pri drugih organizmih se napake podvajanja popravijo, vendar koronavirusi te sposobnosti nimajo. Posledično napake podvajanja pri koronavirusih ostanejo nepopravljene in se kopičijo, kar pa deluje kot vir variacij in prilagajanja v teh virusi. Tako je že od nekdaj narava stvari, da so koronavirusi v svojih genomih izjemno hitro mutirani; več je prenosa, zgodi se več napak podvajanja in s tem več mutacij v genomu, ki vodijo do več variante posledično.
Očitno menjava v novo variante ni nov za koronavirusi. Človek koronavirusi so v novejši zgodovini gradili mutacije v nove oblike. Bilo jih je več variante odgovoren za različne epidemije od leta 1966, ko je bila posneta prva epizoda.
SARS-CoV je bila prva smrtonosna različica, ki je povzročila koronavirus epidemija v provinci Guangdong na Kitajskem leta 2002. MERS-CoV je bila naslednja pomembna različica, ki je leta 2012 povzročila epidemijo v Savdski Arabiji.
Novela koronavirus SARS-CoV-2, različica, odgovorna za trenutno pandemijo COVID-19, ki se je začela decembra 2019 v Wuhanu na Kitajskem in se nato razširila po vsem svetu ter postala prva koronavirus pandemije v zgodovini človeštva, je nenehno podvržen nadaljnjemu prilagajanju, kopičenju mutacij v različnih geografskih regijah, kar je povzročilo več pod-variante. Ti pod-variante imajo manjše razlike v svojem genomu in koničastih proteinih ter kažejo razlike v njihovi hitrosti prenosa, virulenci in infektivnosti imunskega pobega.
Glede na nevarnost, ki jo predstavljajo te podrazličice, so razvrščene v tri kategorije – Variante zaskrbljujoče (VOC), zanimive različice ali različice v preiskavi (VOI) in različice pod nadzorom. To združevanje podrazličic temelji na dokazih v zvezi s prenosljivostjo, imunostjo in resnostjo okužbe.
- Variante skrbi (VOC)
Variante, ki povzročajo zaskrbljenost (VOC) so jasno povezane s povečanjem prenosljivosti ali virulence ali zmanjšanjem učinkovitosti kakršnih koli ukrepov javnega zdravja, kot je učinkovitost cepiv, ki se trenutno uporabljajo.
Oznaka WHO | Rodovine | Država prvič zaznana (skupnost) | Leto in mesec sta bila prvič zaznana |
Alpha | B.1.1.7 | Anglija | september 2020 |
beta | B.1.351 | Južna Afrika | september 2020 |
Gamma | P.1 | Brazilija | december 2020 |
Delta | B.1.617.2 | Indija | december 2020 |
- Zanimive različice ali Variante v preiskavi (VOI)
Znano je, da imajo zanimive različice ali variante, ki so v preiskavi (VOI), genetske spremembe, ki lahko vplivajo na njihovo prenosljivost, virulenco ali učinkovitost ukrepov javnega zdravja in je ugotovljeno, da povzročajo pomemben prenos v skupnosti.
Oznaka WHO | Rodovine | Država prvič zaznana (skupnost) | Leto in mesec sta bila prvič zaznana |
Eta | B.1.525 | Nigerija | december 2020 |
Iota | B.1.526 | ZDA | november 2020 |
Kappa | B.1.617.1 | Indija | december 2020 |
Lambda | C.37 | Peru | december 2020 |
- Variante pod nadzorom
Različice, ki so pod nadzorom, so zaznane kot signali in obstajajo znaki, da imajo lahko lastnosti, podobne HOS, vendar so dokazi lahko šibki. Zato se te različice nenehno spremljajo glede morebitnih sprememb.
Oznaka WHO | Rodovine | Država prvič zaznana (skupnost) | Leto in mesec sta bila prvič zaznana |
B.1.617.3 | Indija | februar 2021 | |
A.23.1+E484K | Anglija | december 2020 | |
Lambda | C.37 | Peru | december 2020 |
B.1.351+P384L | Južna Afrika | december 2020 | |
B.1.1.7+L452R | Anglija | januar 2021 | |
B.1.1.7+S494P | Anglija | januar 2021 | |
C.36+L452R | Egipt | december 2020 | |
AT.1 | Rusija | januar 2021 | |
Iota | B.1.526 | ZDA | december 2020 |
Zeta | P.2 | Brazilija | januar 2021 |
AV.1 | Anglija | marec 2021 | |
P.1+P681H | Italija | februar 2021 | |
B.1.671.2 + K417N | Anglija | junij 2021 |
To združevanje je dinamično, kar pomeni, da se podrazličice lahko odstranijo iz ene skupine ali vključijo v katero koli skupino, odvisno od spremembe ocene groženj glede na prenosljivost, imunost in resnost okužbe.
Ironično se zdi, da je razvoj SAR-CoV-2 trenutno v teku. Glede na naravo tega virus, dokler obstaja prenos med ljudmi, bodo prihajale do napak podvajanja in mutacij. Nekateri mutanti ali različice lahko premagajo selekcijski pritisk, da postanejo bolj nalezljivi in virulentni, ali pa uidejo imunskemu odzivu, zaradi česar je cepivo manj učinkovito. Verjetno bo sčasoma odkritih veliko več različic na območjih z večjo prenosljivostjo. Zmanjšanje prenosa in stalno spremljanje sta ključ do strategij zadrževanja.
***
Viri:
- Prasad U., 2021. Novi sevi SARS-CoV-2 ( virus odgovoren za COVID-19): Ali je lahko pristop 'nevtralizirajočih protiteles' odgovor na hitro mutacijo? Znanstveni evropski. Objavljeno 23. decembra 2020. Na voljo na spletnem naslovu http://scientificeuropean.co.uk/medicine/new-strains-of-sars-cov-2-the-virus-responsible-for-covid-19-could-neutralising-antibodies-approach-be-answer-to-rapid-mutation/
- SZO, 2021. Sledenje različicam SARS-CoV-2. Na voljo na spletu na https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/
- ECDPC 2021. Zaskrbljujoče različice SARS-CoV-2 od 8. julija 2021. Na voljo na spletu na https://www.ecdc.europa.eu/en/covid-19/variants-concern
***