Human Projekt Proteome (HPP) se je začel leta 2010 po uspešnem zaključku Human Projekt genoma (HGP) za identifikacijo, karakterizacijo in kartiranje človeškega proteom (celoten niz beljakovin, ki jih izraža človeškega genom). Ob svoji deseti obletnici je HPP izdal prvi zelo strog načrt, ki pokriva 90.4 % človeškega proteom. Kot koda življenja ima ta mejnik zelo pomembne posledice za človeškega zdravje in terapevtiko.
Dokončano v 2003, Human Genome Project (HGP) je bilo mednarodno sodelovanje, ustanovljeno leta 1990 z namenom identificirati celoten nabor človeškega genov in določiti celotno zaporedje baz DNK v človeškega genom. 15. januarja 2001 je HGP izdal začetno zaporedje in analizo človeškega genom. Prepoznavanje, karakterizacija in kartiranje človeškega proteom (celoten komplement proteinov, ki jih kodira genom) je bil naslednji logični korak. zato Human Organizacija Proteome (HUPO) je bila ustanovljena 9. februarja 2001 za spodbujanje raziskav proteomike. 23. septembra 2010 je HUPO uradno začel delovati Human Projekt Proteome (HPP) z namenom priprave načrta za človeškega proteoma (1).
Analiza človeškega genoma napoveduje približno 20,300 genov, ki kodirajo beljakovine. Celoten nabor proteinov, ki jih kodirajo ti geni, tvoričloveškega proteom'. Human proteom je veliko večji od 'človeškega genoma', ker se en gen lahko izraža v različnih oblikah (proteoformah) kot rezultat kemičnih modifikacij med in po prevodu. Ocenjuje se, da lahko v enem samem posamezniku sobiva milijon proteoform. Leta 2010, ob začetku HPP, je bilo identificiranih komaj 70 % proteinov, predvidenih z analizo genoma. Dnevni red projekta proteom je bil zapolniti to vrzel v znanju. Z napredkom tehnologije je postalo mogoče zaznati in kvantificirati beljakovine in njihove oblike z večjo natančnostjo. Kljub temu obstaja precej manjkajočih beljakovin (beljakovin napovedana z analizo genoma, vendar še vedno neodkrita) (2,3). Projekt je še v teku; vendar je bil dosežen mejnik.
HPP je 16. oktobra 2020 ob svoji deseti obletnici izdal prvi načrt visoke stroge zahteve, ki pokriva 90.4 % človeškega proteoma (1). To bistveno izboljša naše znanje o biologiji človeka in razumevanje molekularnih mehanizmov na celični in molekularni ravni, zlasti vloge, ki jo igra človeški proteom, ki neposredno vodi k izvajanju raziskav in razvoja diagnostike in terapij za raka, srčno-žilne in nalezljive bolezni, zlasti za personalizirane in precizna medicina (4).
Razvoj človeka Beljakovine Atlas predstavlja zelo pomemben napredek za nadaljnje raziskave na področju človeške diagnostike in terapevtike (5,6).
***
Reference:
- HUPO 2021. Časovnica proteomike. Na voljo na https://hupo.org/Proteomics-Timeline.
- neXtProt 2021. Človeški proteom. Na voljo na spletu na https://www.nextprot.org/about/human-proteome Dostop 30. decembra 2020.
- Inserm, 2020. Proteomika: koda življenja prevedena za več kot 90%. Objavljeno 07. decembra 2020. Dostopno na spletu na https://www.inserm.fr/actualites-et-evenements/actualites/proteomique-code-vie-traduit-plus-90 Dostop 30. decembra 2020.
- Adhikari, S., Nice, EC, Deutsch, EW et al. 2020. Zelo strog načrt človeškega proteoma. Objavljeno: 16. oktober 2020. Sporočilo o naravi 11, 5301 (2020). DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-020-19045-9
- Digre A. in Lindskog C., 2020. Atlas človeških beljakovin – prostorska lokalizacija človeškega proteoma v zdravju in bolezni. Protein Science letnik 30, številka 1. Prva objavljena: 04. november 2020. DOI: https://doi.org/10.1002/pro.3987
- Atlas človeških beljakovin 2020. Atlas človeških beljakovin Na voljo na spletu na https://www.proteinatlas.org/about Dostop 30. decembra 2020.
***
